Wojewódzki Inspektorat Ochrony Środowiska w Krakowie stanowi aparat pomocniczy Małopolskiego Wojewódzkiego Inspektora Ochrony Środowiska jako kierownika wojewódzkiej inspekcji wchodzącej w skład zespolonej administracji wojewódzkiej. Działa na obszarze województwa małopolskiego. Małopolski Wojewódzki Inspektor wykonuje w imieniu Wojewody Małopolskiego zadania i kompetencje Inspekcji Ochrony Środowiska  określone w ustawie o Inspekcji Ochrony Środowiska z dnia 20 lipca 1991r. (Dz.U. 2002.112.982 z póź. zm.) i przepisach odrębnych. 

Regulamin organizacyjny  WIOŚ 

Szczegółową organizację i zasady działania Wojewódzkiego Inspektoratu Ochrony Środowiska w Krakowie określa Regulamin Organizacyjny  ustalony zarządzeniem Nr 12/2009 Małopolskiego Wojewódzkiego Inspektora Ochrony Środowiska z dnia 15 września 2009r. i zatwierdzony przez Wojewodę Małopolskiego zarządzeniem nr 498/09  z dnia 28  grudnia 2009r.

W skład Wojewódzkiego Inspektoratu wchodzą:

1. Wydział Inspekcji;
2.  Wydział Monitoringu Środowiska;
3. Laboratorium Wojewódzkiego Inspektoratu z podległymi Pracowniami:
   a) Pracownia Fizykochemiczna,
   b) Pracownia Badań Automatycznych Powietrza,
   c) Pracownia Badań Terenowych,
   d) Pracownia Badań Środowiskowych
4. Laboratorium Wzorcujące;
5.  Wydział Budżetu i Finansów;
6.  Wydział Organizacyjno - Administracyjny;
7.  Samodzielne Stanowisko ds. Prawnych;
8.  Samodzielne Stanowisko ds. Informatycznych;
9.  Samodzielne Stanowisko ds. BHP i Przeciwpożarowych;
10.  Samodzielne Stanowisko ds. Obronnych;
11.  Samodzielne Stanowisko ds. Zamówień Publicznych;
12.  Pełnomocnik ds. Ochrony Informacji Niejawnych;
13.  Delegatury:
    a) w Nowym Sączu,
    b) w Tarnowie.

Wojewódzki Inspektorat Ochrony Środowiska w Krakowie obejmuje swoim działaniem teren województwa małopolskiego.

Mapa obszaru działania WIOŚ
WIOŚ w Krakowie		nadzoruje powiaty: chrzanowski, krakowski, miechowski, myślenicki, olkuski, oświęcimski,  suski,  wadowicki, wielicki  i miasto Kraków
			szczegółowa mapa obszaru działania,  adresy e-mail w WIOŚ w Krakowie
Delegatura w Tarnowie		obejmuje swym zasięgiem działania powiaty : bocheński, brzeski, dąbrowski, proszowicki, tarnowski ziemski i  Tarnów-miasto na prawach powiatu
			szczegółowa mapa obszaru działania,  dodatkowe informacje o Delegaturze w Tarnowie
Delegatura w Nowym Sączu		obejmuje swym zasięgiem działania powiaty: limanowski, gorlicki, nowotarski, tatrzański, nowosądecki i Nowy Sącz-miasto na prawach powiatu
			szczegółowa mapa obszaru działania,  dodatkowe informacje o Delegaturze w Nowym Sączu